Resumen: Los estudios basados en la secuencia están surgiendo como una herramienta importante para los estudios de asociación genética de enfermedades complejas. Estos estudios plantean grandes desafíos para los métodos estadísticos tradicionales (por ejemplo, análisis de un solo locus basados en métodos de regresión) debido a la alta dimensionalidad de los datos y la baja frecuencia de las variantes genéticas. Además, existe un gran interés en la biología y la epidemiología para identificar los factores de riesgo genético que contribuyeron a los fenotipos de enfermedades múltiples. Los múltiples fenotipos a menudo pueden seguir diferentes distribuciones, lo que viola los supuestos de la mayoría de los métodos actuales. En este documento, proponemos una prueba de Similitud U generalizada, denominada GSU. GSU es una prueba basada en similitud y puede manejar genotipos y fenotipos de alta dimensión. Estudiamos las propiedades teóricas de GSU y proporcionamos el cálculo eficiente del valor p para la prueba de asociación, así como el tamaño de la muestra y el cálculo de potencia para el diseño del estudio. A través de la simulación, encontramos que GSU tenía ventajas sobre los métodos existentes en términos de potencia y robustez a las distribuciones de fenotipos. Finalmente, utilizamos GSU para realizar un análisis multivariado de los datos de secuenciación en el Estudio de Dallas Heart e identificamos una asociación conjunta de 4 genes con 5 fenotipos metabólicos relacionados.
Publicado Originalme en export.arxiv.org El 17 de agosto de 2025.
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